Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ube2d4D3YUH6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ube2d4D3YUH6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms