Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Abcc8B2RUS7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Abcc8B2RUS7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms