Protein–RNA interactions for Protein: B2RUR8

Otud7b, OTU domain-containing protein 7B, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud7bB2RUR8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud7bB2RUR8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud7bB2RUR8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms