Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apba1B2RUJ5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 AC116589.3-201ENSMUST00000223034 1165 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Gm6681-201ENSMUST00000205215 607 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apba1B2RUJ5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms