Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brpf1B2RRD7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brpf1B2RRD7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms