Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Uhrf1bp1B2KF50 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms