Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Grik3B1AS29 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Grik3B1AS29 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms