Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm6880A3KG45 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms