Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scn3aA2ASI5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scn3aA2ASI5 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms