Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lcn6A2AJB9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Lcn6A2AJB9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Lcn6A2AJB9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Lcn6A2AJB9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lcn6A2AJB9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms