Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Shisal2aA2A9G7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Shisal2aA2A9G7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Shisal2aA2A9G7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Shisal2aA2A9G7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Shisal2aA2A9G7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms