Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef6A2A8M8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms