Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L1

Chd5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd5A2A8L1 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chd5A2A8L1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms