Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Asb11-201ENSMUST00000033755 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Eqtn-202ENSMUST00000107097 1164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm12655-202ENSMUST00000133884 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm20823-201ENSMUST00000179949 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm20924-202ENSMUST00000186910 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC154643.1-201ENSMUST00000225643 625 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr1495-201ENSMUST00000061669 1089 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Gm3238W4VSP7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms