Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vstm4T1NXB5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms