Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Homer1Q9Z2Y3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Homer1Q9Z2Y3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms