Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
CcniQ9Z2V9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms