Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ubl3Q9Z2M6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Ubl3Q9Z2M6 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms