Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Pdpk1Q9Z2A0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms