Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cldn8Q9Z260 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn8Q9Z260 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms