Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z109

Vsig2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig2Q9Z109 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Vsig2Q9Z109 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms