Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F4

Cib1, Calcium and integrin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib1Q9Z0F4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cib1Q9Z0F4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms