Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PapolbQ9WVP6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms