Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Psma1Q9R1P4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms