Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Plod3Q9R0E1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms