Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nek3Q9R0A5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms