Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AmfrQ9R049 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AmfrQ9R049 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms