Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
CtsjQ9R014 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CtsjQ9R014 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms