Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tnfrsf10bQ9QZM4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms