Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

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Length 621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ChmlQ9QZD5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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