Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf1Q9QZ09 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms