Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

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Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Kcnip3Q9QXT8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Kcnip3Q9QXT8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Kcnip3Q9QXT8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Kcnip3Q9QXT8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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