Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cpsf3Q9QXK7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms