Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trpc5Q9QX29 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms