Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chaf1aQ9QWF0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chaf1aQ9QWF0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms