Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdcQ9QW08 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms