Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sfmbt1Q9JMD1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms