Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SrfQ9JM73 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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