Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Higd1aQ9JLR9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms