Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col5a3Q9JLI2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Col5a3Q9JLI2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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