Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prg3Q9JL95 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prg3Q9JL95 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms