Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lmbr1Q9JIT0 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lmbr1Q9JIT0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms