Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS5

Sv2a, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, mousemouse

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Length 742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2aQ9JIS5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sv2aQ9JIS5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms