Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim2Q9ESN6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim2Q9ESN6 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim2Q9ESN6 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim2Q9ESN6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Trim2Q9ESN6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trim2Q9ESN6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms