Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Clstn2Q9ER65 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms