Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Clstn1Q9EPL2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Clstn1Q9EPL2 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms