Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Tspan4Q9DCK3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Tspan4Q9DCK3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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