Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufa8Q9DCJ5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms