Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hmgn3Q9DCB1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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