Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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